Text
3D QSAR Pharmacophore Senyawa Turunan Asam Hidroxamat Sebagai Inhibitor Tumor Necrosis Factor Alpha (TNF-?)
Ekspresi yang berlebihan dari Tumor Necrosis Factor alpha (TNF-?) yang merupakan sitokin proinflamasi 17 kDa, berkaitan langsung dengan penyakit inflamasi seperti rheumatoid arthritis dan penyakit Chron's. Fitur kimia berdasarkan model 3D QSAR farmakofor telah dikembangkan terhadap senyawa turunan asam hidroxamat sebagai inhibitor TNF-?. Model tiga dimensi farmakofor dibentuk menggunakan program Discovery Studio 2.5, untuk mengetahui fitur - fitur pada senyawa turunan asam hidroxamat yang bertanggung jawab menginhibisi TNF-?. Tahap-tahap pemodelan farmakofor yaitu penyiapan data yang mencakup penggambaran 2D dengan ChemDraw Ultra, optimasi geometri dengan Hyperchem 7.0, Common Feature Generation Pharmacophore dengan perangkat lunak Discovery Studio, pembuatan training set, pharmacophore generation dengan 3D QSAR Pharmacophore, analisis data, dan validasi model. Model farmakofor terbaik (Hipotesis 1) yang terdiri dari satu hydrogen bond donor, satu hydrogen bond acceptor, dan dua hidrofobik, telah dihasilkan dari 28 senyawa training set. Nilai koefisien korelasi, root mean square deviation, dan perbedaan cost berturut-turut yaitu 0,971235, 0,531401 dan 47,373. Hasil tersebut mensugestikan bahwa prediktif tertinggi model farmakofor memiliki validitas yang baik. Aplikasi model tersebut digunakan untuk memprediksi aktivitas 30 senyawa test set yang diketahui sebagai inhibitor TNF-? diperoleh koefisien korelasi 0,773 pada tingkat kepercayaan 95%.
Kata kunci: Asam Hidroxamat, Farmakofor, Inhibitor TNF-?
No copy data
No other version available