Text
Simulasi Molekular Doking Turunan Aspartil Dipeptida Pada Reseptor Metabotropik Glutamat (mGluR)
Aspartam (L-alfa-aspartil-L-Fenilalanin-1-metil ester) yang telah diketahui memiliki rasa manis menegaskan bahwa turunan aspartil-dipeptida juga memiliki potensi sebagai pemanis (Laszlo Tarko et al.,2006), maka mengarahkan untuk melakukan penelitian pada turunan aspartil-dipeptida. Pada penelitian ini dilakukan simulasi molekular doking turunan aspartil-dipeptida sebagai ligan pada target protein, reseptor metabotropik glutamate (mGluR) yang dapat menginduksi sinaps sehingga menimbulkan rasa manis. Penelitian ini dilakukan untuk melihat interaksi asam amino penting dengan ligan dengan memperhatikan interaksi ikatan hidrogen, ikatan hidrofobik, hasil kluster doking, nilai FEB (energi bebas ikatan) dan nilai Ki (konstanta inhibisi). Penelitian ini dimulai dengan penelusuran target protein yang bertanggungjawab memberi rasa manis, penggambaran 2D turunan aspartil-dipeptida, optimasi geometri turunan yang dibina, simulasi doking menggunakan perangkat lunak Autodock 3.05 dan analisis data. Hasil penelitian menunjukkan, gugus karboksilat berinteraksi dengan Lys409, gugus karbonil berinteraksi dengan Arg323, gugus karboksil berinteraksi dengan asam amino Ser186, Lys409 dan Arg78 dan gugus N-H berinteraksi dengan Ser186 dan Asp318 dengan ikatan hidrogen. Beberapa turunan yang mempunyai gugus cincin benzen mempunyai ikatan hidrofobik yang berinteraksi dengan residu asam amino Tyr74 dan Tyr236.
Kata kunci: aspartam, aspartil-dipeptida, doking, pemanis.
No copy data
No other version available