Text

Pemodelan dan Analisis Struktur 3D Reseptor Histamin H4 (H4R) Dengan Modeller dan Swiss-Model

---

Reseptor histamin H4 (H4R) termasuk ke dalam keluarga GPCRs (G protein-coupled receptors) dan terlibat dalam patogenesis gatal, penyakit autoimun seperti radang sendi, penyakit alergi tipe-I seperti asma, radang selaput mata, radang membran mukosa hidung. Akan tetapi, H4R belum pernah dikristalkan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan model struktur 3D H4R yang memenuhi parameter kualitas DOPE dan QMEAN menggunakan prinsip pemodelan homologi, diawali dengan pencarian urutan asam amino H4R, penentuan template (cetakan), pembuatan alignment (pensejajaran) dari urutan asam amino H4R dengan template, pembuatan struktur 3D H4R menggunakan software MODELLER 9v7 dan server SWISS-MODEL, serta analisis model struktur 3D H4R. Penelitian ini menghasilkan 4 buah model H4R yang divalidasi dengan Ramachandran Plot dan model terbaik kemudian dilakukan simulasi docking menggunakan AutoDock Tools v.1.4.4 kemudian dibandingkan dengan model pembanding. Hasil yang diperoleh, H4R yang berasal dari template 2rh1 yang dibuat dengan MODELLER untuk agonis (histamin) berinteraksi dengan Asp94 dan Tyr 319 melalui ikatan hidrogen, sedangkan antagonis (JNJ7777120) berinteraksi dengan Asp94 saja melalui ikatan hidrogen.

Kata kunci: H4R, pemodelan homologi, DOPE, QMEAN

---

Availability @Fakultas Farmasi

No copy data

Detail Information

Series Title

-

Call Number

2313

Publisher

: Fakultas Farmasi Universitas Padjadjaran., 2010

Collation

-

Language

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Classification

2313

Content Type

-

Media Type

-

Carrier Type

-

Edition

NULL

Subject(s)

-

Specific Detail Info

-

Statement of Responsibility

-

Other version/related

File Attachment

Comments

---

You must be logged in to post a comment