No image available for this title
Bookmark Share

Text

Molecular Docking Senyawa Fevicordin Pada Reseptor Estrogen ? Manusia Menggunakan Software MOE

Fevicordin memiliki struktur mirip dengan estradiol dan bersifat sitotoksik sehingga berpotensi untuk dikembangkan menjadi obat kanker payudara. Metode molecular docking dapat digunakan untuk mensimulasikan interaksi fevicordin dengan reseptor estrogen-?-manusia yang diketahui berperan dalam perkembangan sel kanker payudara. Informasi simulasi selanjutnya dapat digunakan dalam optimasi aktivitasnya terhadap target. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis interaksi fevicordin dengan LBD (ligand binding domain) reseptor estrogen-?-manusia dengan metode molecular docking, serta memperkirakan afinitas fevicordin terhadap LBD reseptor estrogen-?-manusia. Validasi metode docking MOE dilakukan dengan docking balik estradiol x-ray dan estradiol hasil pemodelan pada LBD reseptor estrogen-?-manusia. Struktur 3D fevicordin dimodelkan menggunakan metode mekanika molekuler dengan medan gaya MMFF94s dan konformer fevicordin diperoleh dengan Stochastic Conformational Search . Simulasi molecular docking MOE dilakukan untuk tiap konformer pada kantung ikatan estradiol x-ray (SP) LBD reseptor estrogen-?-manusia.. Hasil validasi metode docking membuktikan bahwa MOE dapat memprediksi mode ikatan estradiol x-ray dan estradiol model sesuai mode ikatan estradiol x-ray sesungguhnya. Hasil docking dengan metode scoring Affinity dG menunjukkan bahwa fevicordin memiliki ikatan yang lebih lemah terhadap LBD (ligand binding domain) reseptor estrogen-?-manusia dari pada estradiol. Fevicordin diprediksi terikat pada kantung alternatif LBD reseptor estrogen-?-manusia sehingga diprediksi fevicordin tidak berkompetisi dengan estradiol. Nilai energi bebas ikatan yang diprediksi adalah -12,4645 kkal/mol.

Kata kunci: Fevicordin, Reseptor estrogen, Docking, Estradiol

Availability @Fakultas Farmasi

No copy data

Detail Information
Series Title
-
Call Number
2174
Publisher
: Fakultas Farmasi Unpad.,
Collation
-
Language
Indonesia
ISBN/ISSN
-
Classification
2174
Content Type
-
Media Type
-
Carrier Type
-
Edition
NULL
Subject(s)
-
Specific Detail Info
-
Statement of Responsibility
Other version/related

No other version available

File Attachment
No Data
Comments
You must be logged in to post a comment