Thesis
Prediksi Aktivitas Senyawa Katekin Ekstrak Gambir (Uncaria Gambir [Roxb]) Terhadap UDP-N-Acetylenolpyruvoyl-Glucosamine Reductase (Enzim Murb) Bakteri Streptococcus Mutans Secara In Silico
Prevalensi masalah kesehatan gigi dan mulut pada penduduk Indonesia masih tinggi
terutama karies gigi. Karies gigi bersifat multifaktorial yang dipengaruhi oleh beberapa
faktor termasuk peranan bakteri. Bakteri Streptococcus mutans merupakan salah satu
bakteri yang berperan dalam perkembangan karies gigi. Streptococcus mutans
merupakan bakteri Gram positif yang dapat melakukan metabolisme karbohidrat dan
gula, serta mengubahnya menjadi asam laktat yang menyebabkan karies gigi. Dinding
sel bakteri terdiri atas peptidoglikan. Peptidoglikan merupakan komponen utama dari
bakteri Gram positif dan berperan penting dalam melindungi bakteri. Enzim Mur
memiliki peranan dalam biosintesis peptidoglikan yaitu enzim MurB. Gambir populer
di Indonesia dan memiliki beberapa manfaat. Penelitian yang telah ada sebelumnya
menunjukkann katekin yang berasal dari tumbuhan obat seperti gambir memiliki
aktivitas antibakteri. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengevaluasi dan
memprediksi aktivitas antibakteri katekin yang terkandung dalam gambir terhadap
enzim MurB yang didapatkan dari Uniprot, dan struktur ligan (katekin dan
klorheksidin) yang didapatkan dari Pubchem. Menggunakan Autodock tools untuk
docking antara kedua ligan dengan enzim MurB, dan visualisasi menggunakan Pymol
dan analisis menggunakan Biovia. Hasil menunjukkan katekin memiliki binding
affinity lebih dari -7kcal.mol-1 terhadap enzim MurB dan klorheksidin memiliki
binding affinity yang lebih rendah daripada katekin. Katekin maupun klorheksidin
memiliki ikatan hidrogen dengan perlekatan asam amino yang sama. Hasil
menunjukkan katekin memiliki aktivitas antibakteri yang kompetitif terhadap
klorheksidin dalam menghambat enzim MurB.
Kata kunci : Karies gigi, Streptococcus mutans, Molecular docking, Katekin, Gambir.
No copy data
No other version available