Manuscript
Prediksi Efektivitas Senyawa Methyl Cinnamate pada Kemangi terhadap Enzim Glycosyltransferase B Streptococcus mutans untuk Mencegah Karies Gigi secara In Silico
Pendahuluan: Karies gigi merupakan infeksi endogen kronis yang disebabkan oleh
flora komensal rongga mulut yang normal. Enzim Glycosyltransferase B Streptococcus mutans
memainkan peran penting dalam etiologi dan patogenesis karies gigi. Kemangi (Ocimum
basilicum) merupakan tumbuhan alam yang biasa digunakan sebagai bahan masakan dan
senyawa aktif yang terkandung telah teruji memiliki aktivitas antibakteri. Senyawa aktif yang
terkandung dalam kemangi (Ocimum basilicum) didominasi oleh methyl cinnamate. Penemuan
inhibitor enzim Glycosyltransferase B Streptococcus mutans dapat memfasilitasi
pengembangan obat pencegah karies gigi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi
senyawa methyl cinnamate pada kemangi (Ocimum basilicum) terhadap enzim
Glycosyltransferase B Streptococcus mutans. Metode: Perancangan model secara in silico
dengan metode molecular docking senyawa methyl cinnamate pada kemangi (Ocimum
basilicum) dan enzim Glycosyltransferase B Streptococcus mutans menggunakan peranti lunak
Open Babel 3.1.1, AutoDock Tools 1.5.6, PyMOL 1.7.4, dan Biovia Discovery Studio 2021
Client. Hasil: Hasil docking menunjukkan nilai energi bebas ikatan dan konstanta inhibisi
antara methyl cinnamate terhadap enzim Glycosyltransferase B sebesar -4.93 kcal/mol dan
244.49 μM. Interaksi senyawa membentuk 2 ikatan hidrogen dan 3 ikatan hidrofobik.
Pembahasan:Jika dibandingkan dengan hasil docking kontrol positif, nilai energi bebas ikatan
methyl cinnamate lebih positif dan nilai konstanta inhibisi lebih besar, namun hal ini tetap
menunjukkan bahwa methyl cinnamate memiliki afinitas terhadap enzim Glycosyltransferase
B karena telah mampu berinteraksi pada sisi aktif protein tersebut. Terlihat juga bahwa methyl
cinnamate mengikat residu asam amino yang sama dengan senyawa kontrol positif. Kesamaan
residu asam amino menunjukkan bahwa kedua senyawa memiliki area pengikatan dan posisi
yang sama terhadap enzim Glycosyltransferase B. Simpulan: Methyl cinnamate menunjukkan
efektivitas terhadap enzim Glycosyltransferase B Streptococcus mutans sehingga berpotensi
sebagai antibakteri alternatif berbahan dasar alam untuk mencegah karies gigi.
Kata kunci: Ocimum basilicum, methyl cinnamate, enzim GtfB, streptococcus
mutans
No copy data
No other version available